中国工业微生物菌种保藏管理中心
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菌群结构分析
扩增子测序分析

扩增子测序分析以环境样品微生物群体基因组为研究对象,利用通用引物扩增微生物基因组中的一段保守区域(如细菌的16S rDNA基因V3或V4区、真菌的ITS rDNA序列等),将扩增产物进行高通量测序,下机数据质控后与特定数据库比对来获得物种分类信息,从而获得样品的物种种类、菌群结构、系统发育和遗传多样性等信息。扩增子测序分析建立在高通量测序的基础之上,与传统的克隆文库菌群分析相比,具有准确、全面等优点,相较宏基因组测序分析,更快速、成本低,为复杂环境样品中微生物组成及相对丰度分析提供了分析方法。

扩增子测序.png



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