中国工业微生物菌种保藏管理中心
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CHINA CENTER OF INDUSTRIAL CULTURE COLLECTION
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专题服务
中国药典菌种鉴定

2020版《中国药典》逐步与国际水平接轨,针对微生物菌种管理、菌种检定、菌株分型、菌株溯源、生产过程微生物监测、环境微生物监测等内容进行修订和补充,对我国制药企业在微生物监控管理方面提出了新的要求和挑战。CICC针对客户需求,对制药企业在生产过程中的微生物控制,以及新药申报生产菌种检测等方面开展技术服务。

项目编号项目名称周期(工作日)项目编号项目名称周期(工作日)
CICC-Identi种水平鉴定15-25CICC-FSeq218S rDNA7
CICC-Iso分离纯化15CICC-WGS全基因组测序30
CICC-Spuri菌种纯度15CICC-PFGE脉冲场凝胶电泳25
CICC-SEM扫描电镜 25CICC-RiboTypRibotyping核糖体分型25
CICC-TEM透射电镜25CICC-RAPDRAPD15
CICC-Phage 噬菌体检测25CICC-RepPRep-PCR15
CICC-BIOM生理生化25CICC-EricPEric-PCR15
CICC-Serum 血清学试验20CICC-BoxPBox-PCR15
CICC-MALDI MALDI-TOF质谱快速鉴定5CICC-ARDRATypARDRA酶切20
CICC-SStab 遗传稳定性30CICC-Pc质粒检查25-30
CICC-PStab 生产稳定性30CICC-Ppuri质粒纯度15
CICC-GStab 基因稳定性30CICC-Pquanti质粒拷贝数25-30
CICC-BSus细菌药敏(琼脂扩散法/MIC法/Etest 15CICC-Pratio有/无质粒细菌的比例20
CICC-YSus酵母药敏(MIC法/Etest)15CICC-Ppro质粒产率20
CICC-FSus 小型丝状真菌药敏(MIC法)15CICC-PLrate质粒丢失率20-30
CICC-Virulence菌种毒力 60CICC-DDHDNA-DNA杂交20
CICC-CW 细胞壁化学组分(DAP/糖)15CICC-GC(G+C)mol%(Tm值法/HPLC法)15
CICC-MIDI 脂肪酸15CICC-TPIdenti目的产物的鉴别20
CICC-MetaC 代谢产物含量20CICC-TPExpre目的产物表达量20
CICC-Count     活菌数测定 15CICC-GeneEF基因表达水平和功能活性20
CICC-Ccount 杂菌检查20CICC-Generesi外源性DNA残留15
CICC-Toxin 真菌毒素测定25CICC-Proresi蛋白质残留15
CICC-DValue 生物指示剂耐受性检查30CICC-StrainS种子批系统建立15
CICC-BSeq 16S rDNA7CICC-StrainP菌种专属保藏15
CICC-YSeq 26S rDNA D1/D2区7CICC-SIC密封完整性验证20
CICC-FSeq1 5.8S rDNA ITS区20   


食品用菌种鉴定及安全性评价

2018年中华人民共和国国家卫生健康委员会发布了《食品安全国家标准 食品用菌种(行业内征求意见稿)》,是我国食品用菌种的首个国家标准规范。食品用菌种指“可用于食品中的一种或多种活的微生物(包括细菌、真菌和酵母),经发酵培养、分离、干燥或不干燥等工序制成的产品。按照用途,分为可直接食用菌种和食品发酵用菌种。” 企业“应使用经安全性评价后确认安全的菌种,确保其对人体健康不造成任何急性、亚急性、慢性或者其他潜在性危害。” 同年颁布的《食品用菌种生产卫生规范(征求意见稿)》对食品用菌种的要求做了更细致的规定:企业“外购的原始菌种或自行分离和收集的菌种,应进行菌种鉴定及遗传稳定性试验”。

CICC总结了新资源食品用菌种鉴定的相关服务,CICC将更好的服务于政府监管和行业需求,为食品企业生产菌种申报保驾护航。

法规条文摘录类别项目名称周期(工作日)说明
《食品用菌种生产卫生规范(征求意见稿)》
7.3 食品用菌种
7.3.1 应使用国家相关法规允许使用的菌种。
7.3.2 外购的原始菌种或自行分离和收集菌种,应进行菌种鉴定及遗传稳定性试验。
多相鉴定细菌鉴定15提供菌株分类学地位和生理生化特征的报告
真菌鉴定20
酵母菌鉴定15
分子生物学鉴定16s rDNA序列分析7仅提供菌株分类学报告
ITS rDNA序列分析10
26s rDNA序列分析7
快速鉴定MALDI-TOF MS3快速的菌株分类学报告
菌株分型溯源脉冲场凝胶电泳(PFGE)25以特定目标菌株参考菌株,提供送检菌株在株水平上的基因分型结果报告
核糖体分型(Riboprinter)15
随机扩散DNA多态性(RAPD)25
多基因序列位点分析(MLST)15
全基因组测序(WGS)60
《食品用菌种生产卫生规范(征求意见稿)》
7.3 食品用菌种
7.3.2 外购的原始菌种或自行分离和收集菌种,应进行菌种鉴定及遗传稳定性试验。
《食品安全国家标准食品用菌种(行业内征求意见稿)》
3.1.1 菌种
应使用经安全性评价后确认安全的菌种,确保其对人体健康不造成任何急性、亚急性、慢性或者其他潜在性危害
安全性评价遗传稳定性30菌株安全性评价报告
细菌药物敏感性15
真菌/酵母药物敏感性20
菌种毒力60
溶血性15
全基因组测序(耐药、毒力基因分析;致病性分析)60
毒素检测15


饲用微生物鉴定及安全性评价

近年来我国饲料添加剂产量持续增长。随着我国畜牧业绿色发展需求和“禁抗”政策的实施,直接饲喂微生物和酶制剂等发酵制品类饲料添加剂进入快速发展期。为保障饲用微生物菌株的质量安全,加强菌株的管理,2019年11月农业农村部发布第226号公告,对新饲料添加剂申报中微生物鉴定和菌株安全性评价提出新的要求和挑战。根据公告要求,2021年11月,为进一步规范新饲料和新饲料添加剂安全性评价工作,农业农村部发布了《直接饲喂微生物和发酵制品生产菌株鉴定及其安全性评价指南》农办牧[2021]43号文件,明确了饲料添加剂菌株的鉴定和安全性评价的技术要求。

该指南将为饲料企业、机构开展产品申报提供指导,保障饲料企业生产过程微生物菌株使用的规范性和合规性,对推动饲料行业的快速、健康、持续发展具有深远影响。该指南明确了适用范围:“适用于新饲料添加剂评审和已经批准使用的饲料添加剂再评价时,对直接饲喂微生物和发酵制品生产菌株开展的鉴定及其安全性评价,包括发酵制品中与生产菌株直接相关的安全性评价。适用于通过农业转基因生物安全评价、获得农业转基因生物安全证书的转基因微生物生产菌株及其发酵制品的相关内容评价。饲料或饲料原料发酵生产所用微生物菌株的鉴定及其安全性相关内容评价参照本指南进行。”

表1 菌株鉴定及其安全性评价基本要求

评价内容

指南章节

直接饲喂微生物

发酵制品生产菌株

细菌

酵母和丝状真菌

细菌

酵母和丝状真菌

微生物鉴定

5.1

√

√

√

√

产毒能力和致病性

5.3

√

√

√

√

抗菌药物敏感性

5.4

√


√


抗菌药物产生

5.5

√

√

√

√

生产菌株的遗传修饰

5.6



仅适用于转基因微生物

仅适用于转基因微生物

发酵制品中无生产菌株活细胞评价

5.7



√

√

发酵制品中生产菌株DNA检测

5.8



必要时

必要时

 

表2 微生物鉴定及安全性评价技术服务列表

序号

检测对象

项目编号

检测项目

工作周期(工作日)

对应指南章节

1

菌株

CICC-Identi

菌种鉴定

15-25

5.1

2

CICC-WGSB

细菌全基因组测序(完成图)

30

5.2

3

CICC-WGSY

真菌全基因组测序

60

4

CICC-WGSF

酵母菌全基因组测序

60

5

CICC-virulence

动物致病性

60

5.3.2

6

CICC-Vir

毒力基因分析

30

5.3.3

7

CICC-Tox

毒素检测

30

5.3.4

8

CICC-Sus

药物敏感性

15-20

5.4.1

9

CICC-AMR

耐药基因分析

30

5.4.2

10

CICC-AP

抗菌活性

20

5.5

11

产品

CICC-AOTPS

发酵制品中生产菌株残留

25

5.7

12

CICC-POD

发酵制品中生产菌株DNA检测

30

5.8

 



益生菌菌种鉴定分型与安全性评价

益生菌是指活的微生物,当摄取足够数量时,对宿主健康有益。益生菌的保健功能具备菌株特异性,且需要摄入足够的数量才能达到预期的保健效果。

2019年发布的《益生菌类保健食品申报与审评规定(征求意见稿)》要求申报者提供“株水平上具有功能作用的研究报告”和“菌种鉴定报告(包括表型特征和基于基因分型的菌株水平的 鉴定结果)”;同时规定“益生菌类保健食品在其保质期内每种菌的活菌数目不得少于106 CFU/mL(g)”,且“所用菌种(株)的生物学、遗传学、功效学特性应明确和稳定,菌种(株)及其代谢产物必须无毒无害”。同年发布的《保健食品用菌种致病性评价程序(征求意见稿)》规定企业须“提供由有菌种鉴定资质的检验机构出具的对拟评价菌种规范、科学的分类学(属、种、株名称或株号)资料。“菌种鉴定资料应包含“基于表型或最新基因测序技术确切鉴定到种水平的资料”和“动物致病性试验”及“产毒实验”的评价结果。《保健食品毒理学评价程序(征求意见稿)》规定“对益生菌、真菌等有特殊规定的保健食品,应按规定增加相应的试验,如菌种致病性试验。”

2019年5月,中国食品科学技术学会和中国营养学会均发布了益生菌科学共识,强调活菌数量和菌株特异性应作为益生菌的关键特征。

CICC是专业的益生菌鉴定和安全性评价服务机构,2019年6月,中国工业微生物菌种保藏管理中心(CICC)顺利通过国家市场监督管理总局(原国家食品药品监督管理总局)“特殊食品验证评价技术机构备案”,备案编号: TY06211652。标志着中心获得了为保健食品企业提供菌种鉴定和菌种毒力试验检测,并出具第三方检测报告的国家法定许可。CICC将更好的服务于政府监管和行业需求,促进保健食品产业健康发展。

法规条文摘录类别项目名称周期(工作日)说明
《益生菌类保健食品申报与审批规定(征求意见稿)》
第四项(五)菌种鉴定报告(包括表型特征和基于基因分型的菌株水平的鉴定结果)。
《保健食品用菌种致病性评价程序(征求意见稿)》
第3条
3.2 菌种分类学资料
提供由有菌种鉴定资质的检验机构出具的对拟评价菌种规范、科学的分类学(属、种、株名称或株号)资料。
3.3菌种鉴定资料
根据目前已有的知识,提供基于表型或最新基因测序技术确切鉴定到种水平的资料。
多相鉴定细菌鉴定15提供菌株分类学地位和生理生化特征的报告
真菌鉴定20
酵母菌鉴定15
分子生物学鉴定16s rDNA序列分析7仅提供菌株分类学报告。不能提供“型分类鉴定报告”
ITS rDNA序列分析10
26s rDNA序列分析7
快速鉴定MALDI-TOF MS3快速的菌株分类学报告
菌株分型溯源脉冲场凝胶电泳(PFGE)25以特定目标菌株参考菌株,提供送检菌株在株水平上的基因分型结果报告。
核糖体分型(Riboprinter)15
随机扩散DNA多态性(RAPD)25
多基因序列位点分析(MLST)15
全基因组测序(WGS)60
《益生菌类保健食品申报与审批规定(征求意见稿)》
第四条
(六)菌种(株)的致病性试验、耐药性试验等安全性评价报告。
《保健食品用菌种致病性评价程序(征求意见稿)》
第4条
4.2全基因组测序(Whole Genome Sequencing,WGS)
4.3动物致病性试验
4.4产毒实验
《保健食品毒理学评价程序(征求意见稿)》
5.5.4对益生菌、真菌等有特殊规定的保健食品,应按规定增加相应的试验,如菌种致病性试验
安全性评价遗传稳定性30菌株安全性评价报告。
细菌药物敏感性15
真菌/酵母药物敏感性20
菌种毒力60
溶血性15
全基因组测序(耐药、毒力基因分析;致病性分析)60
毒素检测15


食品遗传修饰微生物鉴定及安全性评价

生物制造是我国战略性新兴产业及未来产业的重点方向,是充分发挥新质生产力作用,打造新增长引擎的重要手段。遗传修饰微生物与生物技术的结合应用,为食品产业的创新发展提供了新的动力。合成生物学的高速发展也带动了食品产业的转型升级,2023年10月,国家卫生健康委员会正式批准生物合成的2’-岩藻糖基乳糖、乳糖-N-新四糖作为营养强化剂应用于食品。2024年9月13日,国家食品安全风险评估中心(CFSA)发布《食品加工用遗传修饰微生物安全性评价申报材料要求(试行)》,对遗传修饰微生物生产的新食品原料、食品添加剂新品种和食品相关产品新品种(简称“三新食品”)的合规性申报提出了明确的要求”。

为赋能食品行业加速发展新质生产力,CICC依据《食品加工用遗传修饰微生物安全性评价申报材料要求(试行)》要求,推出“食品遗传修饰微生物鉴定及评价专题服务”,涵盖遗传修饰微生物及其产品的检测、鉴定和安全性评价等,为三新食品申报提供微生物全面技术解决方案。

序号

项目编号 

检测对象

检测项目

周期(工作日) 

1

CICC-Identi

遗传修饰微生物

细菌/酵母菌/真菌鉴定

15-25

2

CICC-Ap

细菌/酵母菌/真菌动物致病性

60

3

CICC-Bsus

细菌/酵母菌/真菌药物敏感性

15-25

4

CICC-WGS

细菌全基因组完成图测序

30

5

CICC-WGS

真菌/酵母菌全基因组精细图测序

70

6

CICC-Rg

细菌耐药基因

30

7

CICC-Vg

细菌毒力基因

30

8

CICC-TAT

真菌毒素基因

70

9

CICC-Tgn

目的基因核苷酸序列分析

25

10

CICC-Ps

质粒测序

25

11

CICC-Pquanti

外源基因拷贝数

30-40

12

CICC-Tgns

序列稳定性-目的基因核苷酸序列(0代和n代)

30-40

13

CICC-Exs

表达稳定性-目的基因表达量(0代和n代)

个性化定制

14

CICC-TAB

转基因微生物外源蛋白过敏性生物信息学分析

15

15

CICC-Ttn

转基因微生物外源蛋白质与已知毒性蛋白质和抗营养因子的氨基酸序列相似性比较

15

16

CICC-W

基于全基因组序列的遗传修饰细菌脱靶情况分析

30

17

CICC-Psds

产品

生产菌株DNA残留

60

18

CICC-Psr

生产菌株残留

30

19

CICC-Psp

残留蛋白含量

20


饲用转基因微生物鉴定及安全性评价

我国《“十四五”生物经济发展规划》提出,要发展合成生物学技术,实现食品工业迭代升级。在生命健康、生物育种、基础原材料等方面全力攻坚,加快突破关键核心技术,是从根本上改变我国关键领域核心技术受制于人格局的重点。 我国《“十四五”生物经济发展规划》提出,要发展合成生物学技术,实现食品工业迭代升级。在生命健康、生物育种、基础原材料等方面全力攻坚,加快突破关键核心技术,是从根本上改变我国关键领域核心技术受制于人格局的重点。当前,国内外转基因微生物安全性评价法规在逐步完善和细化对于企业合成生物学原料申报工作具有重要指导意义。 《农业转基因生物安全评价管理办法(2022修订)》规定了动物用转基因微生物安全评价应包含受体微生物分类学地位、安全性评价、遗传稳定性、质粒状况、质粒的稳定性及其潜在危险程度;基因操作的安全性评价应包含目的基因的核苷酸序列和推导的氨基酸序列、插入序列的拷贝数、目的基因与载体构建的图谱,载体的名称和来源。此外,农业部办公厅发布《动物用转基因微生物安全评价指南》规定“饲料用转基因微生物是指利用细菌、病毒、哺乳动物细胞、酵母等体系表达的功能性蛋白或肽类(如植酸酶、抗菌肽等)作为饲料添加剂。转基因微生物产品可以是纯化蛋白、活性转基因微生物或灭活转基因微生物。总体评价要求应包括:分子特征、遗传稳定性、转基因微生物的生物学特性、转基因微生物对动物的安全性、转基因微生物对人类的安全性、转基因微生物对生态环境的安全性。” CICC针对客户需求,提供转基因微生物及其产品的保藏、鉴定、研发及安全性评价整体解决方案,助力企业完成产品合规申报,为转基因微生物的安全保驾护航。

序号

项目编号 

检测对象

检测项目

周期(工作日) 

1

CICC-BIdenti

转基因菌株

细菌鉴定

15

2

CICC-FIdenti

真菌鉴定

20

3

CICC-YIdenti

酵母菌鉴定

25

4

CICC-BAp

细菌动物致病性

60

5

CICC-FAp

真菌动物致病性

60

6

CICC-YAp

酵母菌动物致病性

60

7

CICC-Bsus

细菌药物敏感性

25

8

CICC-Fsus

真菌/酵母菌药物敏感性

25

9

CICC-BWGS

细菌全基因组完成图测序

30

10

CICC-FWGS

真菌/酵母菌全基因组精细图测序

70

11

CICC-Rg

细菌耐药基因分析

30

12

CICC-Vg

细菌毒力基因分析

30

13

CICC-Sstab

细菌/真菌/酵母遗传稳定性(出发菌株)

30-60

14

CICC-Tgns

目的基因核苷酸序列(0代和n代)

30

15

CICC-Tgns

目的基因核苷酸序列

25

16

CICC-Pquanti

质粒拷贝数

30

17

CICC-Ps

质粒测序

25

18

CICC-AEP

转基因微生物外源蛋白过敏性生物信息学分析

30

19

CICC-AEA

转基因微生物外源蛋白质与已知毒性蛋白质和抗营养因子的氨基酸序列相似性比较

30

20

CICC-Psds

转基因产品

生产菌株DNA残留

60

21

CICC-Psr

生产菌株残留

30


新种鉴定

微生物新种发表对微生物系统学的研究具有深远的影响。中国已成为全球系统微生物学研究最活跃的地区,2017年《国际系统与进化微生物学杂志》(IJSEM)共发表微生物新种论文800余篇,其中中国作者发表论文300余篇,约占40%。2018年起,IJSEM要求作者在发表新种时提供菌种全基因组测序(WGS)信息。CICC拥有丰富的新种鉴定服务经验,提供包括模式菌株引进、菌种鉴定分析、公开寄存、技术咨询等在内的新种发表“一站式”技术解决方案,检测项目通过ISO 17025实验室认可,检测结果国际互认,数据可靠性具有保障,服务客户在IJSEM上发表的新种论文已超百篇。

项目编号项目名称周期(工作日)说明
CICC-SEM扫描电镜25形态学观察(形貌、表面)
CICC-TEM透射电镜25形态学观察(内部、附属结构)
CICC-BIOMN生理生化25生理生化特征试验
CICC-BIOLOGBIOLOG25基于碳源代谢的鉴定系统
CICC-APIAPI15API鉴定条
CICC-Bsus细菌药敏15琼脂扩散法/MIC法/Etest
CICC-Ysus酵母药敏15MIC法/Etest
CICC-Fsus小型丝状真菌药敏15MIC法
CICC-Cloneseq克隆测序15细菌、酵母、丝状真菌
CICC-GC1(G+C)mol%15Tm值法
CICC-GC2(G+C)mol%15HPLC法
CICC-FmorDNA-DNA杂交20复性速率液相分子杂交法
CICC-Lipid脂肪酸15MIDI Sherlock鉴定系统
CICC-Quin泛醌/甲基萘醌15细菌 TLC+HPLC法
CICC-Plipid极性脂15细菌TLC法
CICC-CWS细胞壁组分(糖)15细菌TLC法
CICC-CWA细胞壁组分(氨基酸)15细菌TLC/HPLC法
CICC-preservel菌种保藏10取得CICC菌种编号


微生物检验替代方法开发及验证

随着现代生物技术及交叉学科研究的快速发展,基于新理论、新技术的微生物检验方法不断涌现。与传统微生物方法相比,新方法通常具备快速简便、灵敏度高、检测效率高等优点,因此开展新方法验证研究及标准化应用成为近年来行业共同关注的热点。 为鼓励方法创新及行业应用、提升微生物检验能力水平,ISO、AOAC等国际组织和多国政府部门陆续发布实施关于微生物学方法验证的标准/指南(见表1),要求微生物实验室采用非标准中规定的检验方法(即替代方法)时,应根据不同微生物检验方法类型选择相应参数进行替代方法性能验证,确认其检测效果优于或等同于标准方法。替代方法验证研究具有系统性、专业性、跨学科等特点,我国目前尚缺少应用相关标准系统开展方法验证的公开案例。CICC研究团队长期从事工业微生物检测及鉴定技术相关研究,保藏有食品、药品、化妆品微生物检验标准菌株及工业环境来源菌株资源,组织成立了不同行业领域及专业背景的技术专家组,建立了相对完善的方法开发和验证技术体系,并初步取得了相关系列研究及应用成果。 为了共同推动新技术的开发研究与行业应用,CICC现面向微生物检验替代方法的研发方或使用方,以技术服务、委托研发和联合研发等多元化形式,提供方案设计、研究实施、统计分析、研究报告、科研论文、行业专家评审等全方位服务。欢迎咨询。 联系人:葛媛媛;蒋晓莹 电话:010-53218303/15010084337; 010-53218302 E-mail:lucy@china-cicc.org; tech@china-cicc.org。

表1

项目 参照标准 定性检验定量检验
食品微生物检验方法验证ISO 16140 Microbiology of food chain-Method Validation
 Part 2 Protocol for the validation of alternative (proprietary) methods against a reference method
Sensitivity, RLOD, Inclusivity and ExclusivityRelative trueness, Accuracy, LOQ, Inclusivity and Exclusivity
AOAC INTERNATIONAL Methods Committee Guidelines for Validation of Qualitative and Quantitative FoodMethod comparison-Inclusivity and Exclusivity; CS- Significant Difference, Sensitivity, Specificity, False Negative, False PositiveMethod comparison-Inclusivity and Exclusivity; CS - Analysis of Variance, Repeatability, Reproducibility, RSD
药品/化妆品微生物检验替代方法验证《中国药典》(2015版)9201药品微生物检验替代方法验证指导原则专属性、检测限、耐用性、重现性准确度、精密度、专属性、定量限、线性、范围、耐用性、重现性
USP <1223> Validation of alternative microbiological methodsSpecificity, Limit of detection, Repeatability, Robustness, Repeatability, EquivalencyAccuracy, Precision, Specificity, Limit of detection, Limit of quantification, Linearity, Range, Robustness, Repeatability, Repeatability, Equivalency


联系方式

联系人:蒋晓莹 逄诗玥 姜岩

电话:010-53218312,010-53218311

传真:010-53218307

E-mail:tech@china-cicc.org

样品邮寄

地址:北京朝阳区酒仙桥中路24号院6号楼,中国食品发酵工业研究院

邮编:100015

收样人:李凌

电话:010-53218311


付款方式

1、汇款

账户名:中国食品发酵工业研究院有限公司开户行:中国农业银行北京展览中心支行帐号:11044301040001596

温馨提示:

推荐公对公汇款。

如采用网银,支付宝等个人对公汇款,需在汇款备注中写明开发票单位全称,如未备注,则需提供盖有开发票单位全称公章的代付证明, 方可开具发票。
请在汇款备注中写明“菌种服务”,方便确认到款情况。
当日汇款后第二个工作日下午4:00可以查询到款情况。

2、现场支付

支持现金、支票、刷卡付款,暂不支持微信、支付宝等扫码付款。

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