在国家配套政策法规和合理有效共享机制的保障下，建立起跨部门、跨地区、跨行业的由国家工业微生物菌种资源中心及区域分中心和行业分中心组成的工业微生物菌种资源网络体系；按照统一的建设规范、描述规范和技术规程，建成结构完整、功能齐全、动态发展、开放高效并与国际接轨的工业微生物菌种资源平台，形成完善的工业微生物菌种资源实物与信息共享服务体系；全面掌握国家食品工业、发酵工业、轻化工、生物转化以及石油、环保等工业领域应用微生物菌种资源状况，促进工业微生物菌种资源的保护、共享和利用，更好地为工业领域的科技创新、生产开发、科学普及、政府决策、人才培养和社会经济发展服务。

实物层：

　　建成具有先进水平的手段齐全的工业微生物菌种资源库，具有包括液氮保藏库、超低温保藏库、大型低温菌种库等基础设施，具备工业微生物菌种资源分析、鉴定和分子育种的技术手段，整合全国工业微生物菌种存量和增量资源10000株，并进行标准化整理与数字化表达，完成其中6000株菌种的复核鉴定，完成20万份工业微生物菌种的共享备份整理与准备。全面实现工业微生物菌种实物资源和信息资源的优质高效社会共享。

数据库层：

　　建成符合国家自然科技资源平台要求的工业微生物资源数据库，数据库资源信息10000条，包含较为完备的工业微生物资源共性描述信息，菌种资源分类描述信息，资源管理信息等。

应用网络层：

　　建成以中心网络为核心，连接各分中心网络系统，并可以直接与国家平台网络体系接轨的网络体系，构成完善的国家工业微生物菌种资源平台，实现工业微生物菌种资源的网络共享。

　　工业微生物菌种资源平台将在国家自然科技资源平台的总体规划下，建立一整套的政策法规，为平台建设提供强有力的保障，其中包括：《工业微生物菌种资源收集、保藏及委托保藏的规定》，对菌种收集和保藏过程中出现的法律依据、知识产权保护、收集保藏条件等方面建立规范的制度；《生产用微生物菌种的管理条例》，安全生产已经成为社会广为关注的重大问题，直接关系到人们的身体健康和社会稳定，为了加强工业应用微生物的安全意识，规范生产管理，建议施行应用微生物的备案制度，企业所采用的工业用微生物生产菌种应在国家工业微生物资源菌种库保存备案，确保工业生产的安全；《工业微生物菌种资源科技成果的鉴定、评价与保护条例》、《工业微生物菌种资源共享条例》和《工业微生物菌种进出口管理规定》等。　　　

　　工业微生物菌种资源平台的运行机制：食品工业微生物菌种资源平台为全国性的公益和服务性机构，由资源平台管理委员会、专家委员会、检查监督委员会共同负责中心的运行。平台将实行管理委员会领导下的中心主任负责制，挂靠中国食品发酵工业研究院。平台管理委员会由挂靠单位和领域内的管理人员和专家组成，管理委员会负责中心方针政策的把握及中心主任的任命。专家委员会由从事食品工业微生物的专家组成，负责中心的技术评价和业务发展。检查监督委员会由挂靠单位和管理委员会推荐人员组成，负责中心的运行监督。中心主任负责主持中心的科研与管理工作，并组织实施管委会决议，组织实施中心年度计划，拟定中心内部管理机构设置方案及管理制度，提请聘任或者解聘中心副主任。

　　在国家微生物资源平台的统一规划下，制订包括《国家微生物平台资源分类与编码标准》、《国家微生物资源共性描述规范》、《微生物菌种资源描述规范》、《酵母菌菌种描述规范》、《小型丝状真菌菌种描述规范》、《工业微生物安全性分类分级标准》、《工业微生物菌种保藏管理办法》、《工业微生物安全性评价的技术规范》等近30种菌种资源描述规范与技术规范。

　　目前中心及各分站共保藏食品工业微生物菌种6000余株，10万余份，由于近十年来，各站的菌种收集与保藏工作是独立进行的，普遍存在着重复保藏和缺乏备份保藏的现象。平台建设项目启动后，首先由中国食品发酵工业研究院组织各参加单位的领导和项目负责人进行思想交流，贯彻国家微生物资源平台建设的规划、意义和内容，引起各单位的足够重视，确保平台项目的顺利进行；同时组织各参加单位的技术人员，进行平台资源描述规范和技术标准的培训工作；在此基础上，落实工作方案，明确任务分工，有序开展工作。

　　各单位按照国家自然科技资源平台的《资源分类和编码标准》和《微生物资源共性描述规范》对库存菌种进行科学分类和初步整理，并将信息整理进入由平台统一提供的微生物资源数据库，并汇总于牵头单位的工业微生物资源数据库；

　　各单位提交准备进行标准化整理的菌株目录，并将菌种备份在中国食品发酵工业研究院中国工业微生物菌种保藏中心保存，同时按照平台制订的微生物分类描述标准开展菌株的标准化整理、序列鉴定和功能性测定等工作，并将整理结果按照平台规范进行数字化表达，将数据库提交菌种中心汇总；

　　菌种中心对各单位送交的菌种信息和实物进行核查，并对其中部分菌株进行复核，确认无误后，将该菌株正式建档入工业微生物菌种库保存，进入国家工业微生物资源共享平台，实现社会共享。

　　工业微生物菌种资源平台增量资源建设将通过引导国家有关部门、地方及企业共同参与平台建设，组织开展工业微生物菌种资源收集活动或与国际菌种保藏机构交换交流等方式实现，菌种增量资源建设的任务为：

　　2003－2005年，库藏菌种5000株，完成菌种相关资料整理2500份；

　　2006－2008年，库藏菌种8000株，完成菌种相关资料整理4000份，引进国际菌种200株，建立工业应用微生物标准菌库和模式菌库；

　　2009－2010年，库藏菌种10000株，完成菌种相关资料整理5000份，引进国际菌种500株。

　　工业微生物菌种资源平台将按照国家微生物资源平台提供的统一数据库改造原有的数据库，增大库容，设立专业子库，各分站在中心指导下，按统一的技术标准，对建档及进行了备份保藏的菌种进行数据分析与整理，建立专业子库。

　　通过基础设施的完善和关键技术的建立，对菌种的存量和增量资源按技术规范进行分析和研究，获得信息数据进入平台数据库：2005年，网络数据库信息5000条。2008年，网络数据库信息8000条。2010年，网络数据库信息10000条，实现网络共享，构成完善的国家工业微生物菌种资源平台。

　　在已有的传统微生物分类技术基础上，建立菌体细胞壁、糖类、脂肪酸分析等化学分类鉴定技术，及DNA组成、DNA同源性，核酸片段多型性分析(RFLP)，DNA随机扩增多型性分析(RAPD)等分子生物分类鉴定方法，提高菌种中心分类鉴定技术能力。

　　菌种选育是工业微生物菌种保藏中心重要的创新工作内容之一。要使发酵工业产品的产量、质量和安全性有较大的改善，首先必须选育性能优良的生产菌种。中心将在自然选育的基础上，建立诱变育种、杂交育种、原生质体融合和基因工程等技术，进行菌种选育，其中通过分子生物学手段，定向构建基因工程菌是中心微生物育种的重要发展趋势。同时将在现有基础上建立更为科学、与各种不同类型的生长和代谢的微生物相适应的分离筛选方法（平皿快速检测法、摇瓶培养法、抗生素法、菌丝过滤法、夹层培养法、生长谱法等）。

　　建立基因库及保存技术是国际菌种保藏机构的一个重要发展方向，工业微生物菌种资源平台将建立包括构建基因库，快速DNA萃取及定序技术等多项关键技术，以推动我国生物技术产业创新发展。

　　工业微生物菌种资源平台对资源按照平台要求进行妥善保藏，包括采用以保藏的目的的长期保藏手段和以共享推广为目的的短期保藏手段。每株菌种都采用两种以上的保藏方法，并根据保藏菌种的保质期，每隔一定时间，进行入藏菌种的复活检验和更新，并登记备案；根据社会对菌种资源的需求，对每株菌种资源分别制备20－100支共享备份，提供社会共享。

　　通过资源平台建设，建立、培养和稳定一支专业人才队伍，在专业和技术领域能够相互配合和相互补充，充分利用社会资源，确保平台建设各项内容的完成。工业微生物资源平台建设专业人员达到45人，其中中心人员15人，各分站人员5人。