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中国工业微生物菌种保藏管理中心

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  • 北京市朝阳区酒仙桥中路24号院6号楼,100015
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菌种鉴定

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CICC是我国唯一的国家级工业微生物菌种保藏管理中心,有近三十年菌种分类鉴定的历史,拥有先进的生物科学仪器和从事分类鉴定的专业化人员队伍,于2012年通过ISO9001质量管理体系认证,2016年通过ISO 17025国家实验室认可。CICC承担全国工业微生物菌种的委托鉴定工作,所提供的菌种鉴定与评价技术服务获得“国家工商总局(SCIC)经营许可”,为国内科研机构、大专院校和生产企业等提供微生物菌种鉴定服务,涉及细菌、酵母、放线菌和丝状真菌等多类微生物。菌种鉴定手段包括形态学观察、生理生化特性鉴定、 BIOLOG碳源自动分析鉴定、分子生物学鉴定、API细菌数值鉴定、功能性分析及功能基因、RAPD、SSCP、TLC薄层层析、全细胞脂肪酸分析鉴定、(G+C)mol%测定、DNA/DNA同源性测定等。

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说明:
  • 1.请务必仔细阅读、填写和提交《微生物菌种鉴定评价协议书》,未填写协议书的样品本中心将不予受理。 
  • 2. 业务受理:(1)现场办理:请您直接到北京市朝阳区酒仙桥中路24号院6号楼办理协议签订、付款、样品提交等手续。现场办理可接受现金、同城支票、银行转账的付款方式。(2)远程办理:您可以经电话咨询后,通过E-mail或传真提交《微生物菌种鉴定评价协议书》,通过邮寄提交样品,通过银行转账进行付款。
  • 3.样品邮寄:请标识送检样品名称或编号,并确保与《微生物菌种鉴定评价协议书》中填写的信息一致,样品如为菌种,请提供1支备份,并注意样品邮寄过程中的包装防护和温度防护。
  • 4. 送样要求:委托鉴定菌株应为非致病菌,且来源明确;若属于中华人民共和国卫生部制定的《人间传染的病原微生物名录》之内菌株,CICC有权停止试验或加收20%鉴定费用。
  • 5.正常工作时间的每天上午09:00前收到样品(含邮寄样品和现场收样),则自当日起计算报告完成时间,如上午09:00后收到样品,则以次工作日起计算。星期六、日及公众假期为非工作日。
  • 6. 部分项目提供加急服务,费用为1.5倍,详情请来电咨询。
  • 7.依据菌种的种类、鉴定难易程度,鉴定费用有所不同,具体事宜请来电咨询。
  • 8. 鉴定技术服务执行预付全款制度,鉴定报告完成后将连同发票快递给客户。
  • 9.本中心原则上提供一份中文鉴定报告纸质原件,如客户要求增加出具英文鉴定报告、电子鉴定报告或鉴定报告副本,将酌情收取部分费用。

回到顶部鉴定项目

CICC 菌种鉴定与评价服务项目

序号

项目编号

项目名称

周期/工作日

备注/适用范围

1

CICC-BSeq03

16S rDNA

3

细菌

2

CICC-YSeq03

26S rDNA  D1/D2

3

酵母

3

CICC-FSeq05

5.8S rDNA  ITS

5

小型丝状真菌

4

CICC-BSeq07

16S rDNA 

7

细菌

5

CICC-YSeq07

26S rDNA  D1/D2

7

酵母

6

CICC-FSeq10

5.8S rDNA  ITS

10

小型丝状真菌

CICC-Identi

种水平鉴定

10

细菌、酵母

20

放线菌、霉菌

CICC-BHGen01

gyrA 基因

5

芽孢杆菌属

CICC-BHGen02

gyrB 基因

5

假单胞菌属、芽孢杆菌属、肠杆菌属、克雷伯氏菌属

10 

CICC-BHGen03

pheS 基因

5

乳酸菌属、肠球菌属

11 

CICC-BHGen04

recN 基因

5

明串珠菌属、链球菌属

12 

CICC-BHGen05

rpoB 基因

5

葡萄球菌属

13 

CICC-BHGen06

trpB 基因

5

链霉菌属

14 

CICC-BHGen07

atpD 基因

5

双歧杆菌属

15 

CICC-FHGen01

β-tubulin 基因

5

曲霉属、青霉属、毛霉属

16 

CICC-FHGen02

calmodulin 基因

5

曲霉属、青霉属

17 

CICC-FHGen03

EF1-α 基因

5

毛霉属、根霉属、木霉属

18 

CICC-FHGen04

Actin 基因

5

毛霉属、根霉属

19 

CICC-BIOLOG

BIOLOG

7

基于C源代谢的自动化鉴定系统

20 

CICC-API

API 

7

细菌、酵母

21 

CICC-BIOM

生理生化

10

细菌、酵母

20

放线菌

22 

CICC-BIOMN

生理生化(新种、特殊种)

30

如为潜在新种,参考新种发表试验要求

23 

CICC-SEM

扫描电镜

10

形态学特征观察(形貌、表面)

24 

CICC-TEM1

透射电镜(负染)

10

形态学特征观察(附属结构)

25 

CICC-TEM2

透射电镜(切片)

10

形态学特征观察(内部 )

26 

CICC-GC1

G+Cmol%

10

Tm值法含量测定

27 

CICC-GC2

G+Cmol%

15

HPLC

28 

CICC-DDH

DNA-DNA杂交

15

菌种基因组DNA 同源性测定

29 

CICC-Lipid

脂肪酸

8

细菌、放线菌化学分析

30 

CICC-Quin

泛醌/甲基萘醌

8

31 

CICC-PLipid

极性脂

8

32 

CICC-CWS

细胞壁化学组分(糖)

8

33 

CICC-CWA

细胞壁化学组分(氨基酸)

8

34 

CICC-RAPD

RAPD

15

菌株分型,用于菌种溯源,产权纠纷等

35 

CICC-SSCP

SSCP

15

36 

CICC-RepP

Rep-PCR

15

37 

CICC-EricP

Eric-PCR

15

38 

CICC-BoxP

Box-PCR

15

39 

CICC-ARDRATyp

ARDRA 酶切

10

40

CICC-RiboTyp

Ribotyping核糖体分型

15

41 

CICC-PFGE

脉冲场凝胶电泳

25

42

CICC-Isolation

菌种分离纯化

15

混合样品中菌种的分离纯化

43 

CICC-Count

特定菌菌落计数

15

乳杆菌、双歧杆菌、磷细菌、硝化菌、反硝化菌

44 

CICC-GStab

遗传稳定性

30

生产菌种等遗传稳定性试验

45

CICC-Enzyme

酶活测定

10

蛋白酶/淀粉酶/果胶酶/植酸酶/纤维素酶/糖化酶/过氧化氢酶/脱氢酶/脲酶等

46 

CICC-BSus

细菌药敏

15

琼脂扩散法/MIC/Etest

47

CICC-YSus

酵母药敏

15

MIC/Etest

48 

CICC-FSus

小型丝状真菌药敏

15

MIC

49 

CICC-BIOLOGECO

BIOLOG ECO板生态分析

15

微生物菌群分析,用于环境、水质、传统酿造行业等混合样品的非培养法微生物菌群分析

50 

CICC-DGGE

DGGE样品制备及检测

30

51 

DGGE跑胶

52 

DGGE切胶、纯化、克隆、测序

53 

DGGE结果分析

54 

CICC-16SLib

样品制备及检测

30

55 

16S rDNA 克隆文库构建

56 

克隆子筛选及测序(200)

57 

结果分析

58 

CICC-MAnaly

产品微生物解析(培养法)

20

微生物发酵产品控制

59 

CICC-Contamin

污染菌分析(培养法)

20

60 

CICC-Phage

噬菌体检测(阴性)

5

61 

噬菌体检测(阳性)

15

62 

CICC-FBroth

发酵液制备(30L

15

——

63 

CICC-RTPCR

标准品制备及检测

20

微生物定量分析,用于食源性致病菌、临床、工业等微生物菌种的相对定量/绝对定量分析

64 

样品制备及检测

65 

相对定量(Taqman探针法/SYBR Green 染料法)

66 

绝对定量(Taqman探针法/SYBR Green 染料法)

67

结果分析

68

CICC-Clo

肉毒梭菌检测

7

SNT 2525-2010 食品中肉毒梭菌的PCR检测方法

69

CICC-virulence

菌种毒力

40

适用于微生物菌种安全性评价

70

CICC-antigene

菌种抗生素耐药性基因检测

15

71 

CICC-antivirus

菌种抗病毒能力评价

30

适用于微生物菌种功能性评价

72

CICC-MetaC

代谢产物含量测定

10

酸、醇、酮等,适用于微生物菌种功能性评价

73

CICC-Fmor

形态学鉴定

20

小型丝状真菌

74

CICC-LAMP

环介导等温扩增

10

微生物快速诊断

75

CICC-metag

宏基因组分析

50

Miseq PE测序

76

CICC-wgen

全基因组测序

60

illumina Hisea2000

77

CICC-genoextra

核酸提取

10

微生物基因组/mRNA/RNA的高效提取

78

CICC-expB

蛋白质细菌表达系统的表达与纯化

35

无需修饰的蛋白质的高效表达系统构建,启动强度优化、质粒拷贝数优化、表达条件优化。

79

CICC-expY

蛋白质酵母表达系统的表达与纯化

35

蛋白质真核表达系统的构建,包括启动强度优化和表达条件优化

80

CICC-antipre

抗原设计与制备

60

大分子抗原(10kD以上)序列优及小分子抗原结构设计。抗原制备服务包括大分子、小分子、细菌、真菌等菌体抗原的制备。

81

CICC-antitag

抗体标记

20

生物素标记/酶标记/荧光素标记

82

CICC-antimT

抗原性物质定性及半定量分析

10

目的抗原:蛋白/小分子/细菌/病毒

83

CICC-proT

蛋白质定性定量分析

15

/

注:特殊样品交付周期适当延长,其最终解释权归CICC所有。

回到顶部2015版药典

2015版药典即将于今年12月实施,新版药典逐步与国际接轨,修改或新增了微生物菌种管理、菌种检定、菌种鉴定、菌株分型、菌株溯源、生产过程微生物监测、环境微生物监测等内容,对国内制药企业在微生物监控管理方面提出了新的要求和挑战,针对客户需求,CICC对此进行了梳理,以方便国内制药企业在生产过程的微生物控制及新药申报生产菌种管理方面快速理解和符合新版药典的要求。

一、生物制品

生物制品生产检定用菌毒种管理规程

生物制品生产用菌毒种应采用种子批系统。生产用菌毒种应按各论要求进行检定。应对生产用菌毒种已知的主要抗原表位的遗传稳定性进行检测,并证明在规定的使用代次内其遗传性状是稳定的。菌毒种经检定后,应根据其特性,选用冻干或适当的方法及时保存。保存的菌毒种传代或冻干均应填写专用记录。

生物制品各论中涉及的微生物检定

培养物纯度、培养特征、染色镜检、电镜检查、生化反应、血清学特性、对抗生素的抗性、毒力试验、免疫力试验、免疫原性试验、抗原性试验、目的基因核苷酸序列测定、质粒DNA检测、质粒拷贝数、DNA残留、蛋白质残留等。

二、微生态活菌制品

微生态活菌制品总论

生产用菌种应按照“生物制品生产检定用菌毒种管理规程”的有关规定建立种子批系统。

菌种的属、种型分类鉴定,应依据最新版伯杰氏细菌系统鉴定手册(Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology)和伯杰氏细菌命名手册(Bergey’s Manual of Determinative Bacteriology)的有关规定,包括形态、生长代谢特性检查,原始种子或主种子还应作遗传特性和抗生素敏感性等检查。

三级种子批常规检查包括培养特性及染色镜检、生化反应、毒性试验, 除另有规定外,原始种子或主种子批还需进行以下检查:细菌代谢产物-脂肪酸测定、遗传特性分析、抗生素敏感性试验、稳定性试验。

三、微生物鉴定指导原则(通则9204

微生物鉴定是药品微生物检验中的重要环节,药典附录相应章节中对检出微生物的鉴定做了明确规定,如“非无菌产品的微生物检查:控制菌检查”(通则1106)中选择培养基或指示培养基上发现的疑似菌落需进行鉴定;对“无菌检查法”(通则1101)的阳性实验结果中分离的微生物进行鉴定,以判定试验是否重试;药品洁净实验室微生物监测和控制指导原则(通则9203)中建议对洁净室和其他受控环境分离到的微生物进行鉴定,以掌握环境微生物污染情况,有助于污染调查。此外,在药品生产中,有时亦需对药物原料、辅料、制药用水、生产环境、中间产物和终产品中检出的微生物进行适当水平的鉴定。

微生物鉴定内容包括待检菌的分离纯化、氧化酶试验、过氧化氢酶试验、凝固酶试验、培养特征、细胞特征、生理学特征、生化反应、抗生素敏感性、血清学特征、脂肪酸、微生物毒素、全细胞组分、DNA-DNA杂交、GC摩尔百分含量、PCR反应、16S rRNA序列、18S rRNA序列、MLST、DNA探针、核糖体分型、限制性酶切片段图谱等。

菌株水平的鉴定在污染调查过程中非常有用,当产品中的微生物数量高于建议水平或出现异常高的微生物检出率时尤其适用。菌株水平的鉴定在无菌工艺中也很重要,在无菌试验结果阳性和培养基灌装等模拟工艺失败时,必须对检出的微生物进行评估。菌株水平鉴定技术方法包括限制性核酸内切酶酶解、Southern杂交、PFGE、全基因组测序、血清型等。

2015版药典CICC微生物技术服务列表:

序号

项目编号 项目名称 工作日 15版药典适用条款
 1 CICC-Identi 种水平鉴定 10-20 生物制品各论菌种检定:平板划线应呈典型集落形态,无其他杂菌生长;染色镜检应为典型形态;生化反应符合菌种反应特性。 微生态活菌制品总论:菌种的属、种型分类鉴定,包括形态、生长代谢特性检查。 9204 微生物鉴定指导原则:微生物鉴定是药品微生物检验中的重要环节。
 2 CICC-Spuri 菌种纯度 20 按附录Ⅶ方法做纯菌检查,生长物做涂片镜检,应符合菌种特征,不得有杂菌。
 3 CICC-BSeq 16S rDNA 3/7 9204 微生物鉴定指导原则:菌种鉴定 遗传特性分析,可采用16S rRNA序列测定或其它适宜方法进行,应符合该菌种的遗传特性。
 4 CICC-YSeq 26S rDNA D1/D2区 3/7 9204 微生物鉴定指导原则:菌种鉴定
 5 CICC-FSeq1 5.8S rDNA ITS区 5/10 9204 微生物鉴定指导原则:菌种鉴定
 6 CICC-FSeq2 18S rDNA 5/10 9204 微生物鉴定指导原则:菌种鉴定
 7 CICC-BIOM 生理生化 20 生物制品各论菌种检定:平板划线应呈典型集落形态,无其他杂菌生长;染色镜检应为典型形态;生化反应符合菌种反应特性。 微生态活菌制品总论:菌种的属、种型分类鉴定,包括形态、生长代谢特性检查。 9204 微生物鉴定指导原则:菌种鉴定
 8 CICC-geneS 目的基因核苷酸序列 10 生物制品各论菌种检定:目的基因核苷酸序列应与批准的序列相符。
 9 CICC-pc 质粒检查 15 生物制品各论菌种检定:质粒的酶切图谱应与原始重组质粒相符。
 10 CICC-pquanti 质粒拷贝数 15 生物制品各论菌种检定
 11 CICC-PD 质粒检测 15 生物制品各论菌种检定:该质粒的酶切图谱应与原始重组质粒相符。
 12 CICC-SEM 扫描电镜 10 生物制品各论菌种检定:应为典型形态,无支原体、病毒样颗粒及其他微生物污染。
 13 CICC-TEM 透射电镜 10
 14 CICC-SIC 密封完整性验证-微生物侵入法 20 药品GMP指南-无菌药品分册
 15 CICC-RAPD RAPD 15 9204 微生物鉴定指导原则:菌株分型,污染菌溯源分析
 16 CICC-SSCP SSCP 15
 17 CICC-RepP Rep-PCR 15
 18 CICC-EricP Eric-PCR 15
 19 CICC-BoxP Box-PCR 15
 20 CICC-ARDRATyp ARDRA 酶切 10
 21 CICC-RiboTyp Ribotyping核糖体分型 15
 22 CICC-PFGE 脉冲场凝胶电泳 25
 23 CICC-DDH DNA-DNA杂交 15 9204 微生物鉴定指导原则:菌种鉴定
 24 CICC-CW 细胞壁化学组分(糖/氨基酸) 8 9204 微生物鉴定指导原则:菌种鉴定
 25 CICC-GStab 遗传稳定性 30 生物制品生产检定用菌毒种管理:应对生产用菌毒种已知的主要抗原表位的遗传稳定性进行检测,并证明在规定的使用代次内其遗传形状是稳定的。 微生态活菌制品总论:菌种在适宜培养基中,连续传代30代次后,将第30代培养物做种子批检定,全部检查结果应与原始菌种的特性一致。
 26 CICC-BSus 细菌药敏(琼脂扩散法/MIC法/Etest) 15 微生态活菌制品总论:抗生素敏感性试验采用琼脂扩散纸片法或其他适宜方法,应符合该菌种特性。 生物制品各论菌种检定:对抗生素的抗性应与原始菌种相符。
 27 CICC-YSus 酵母药敏(MIC法/Etest) 15
 28 CICC-FSus 小型丝状真菌药敏(MIC法) 15
 29 CICC-virulence 菌种毒力 40 生物制品各论菌种检定:菌种毒力 微生态活菌制品总论:毒性试验是通过动物试验检查菌种是否存在不安全因素,以保证人体使用安全。
 30 CICC-MetaC 代谢产物含量 10 微生态活菌制品总论:细菌代谢产物——脂肪酸测定按照气相色谱法或其他适宜方法进行,应符合该菌种的特性。
 31 CICC-wgen 全基因组测序 60 9204 微生物鉴定指导原则:菌株分型,污染菌溯源分析
 32 CICC-generesi 外源性DNA残留 15 生物制品各论菌种检定
 33 CICC-proresi 蛋白质残留 15 生物制品各论菌种检定
 34 CICC-fdp 冻干管加工 5 生物制品生产检定用菌毒种管理:菌毒种经检定后,应根据其特性,选用冻干或适当的方法及时保存。保存的菌毒种传代或冻干均应填写专用记录。

回到顶部新种鉴定

CICC新种鉴定

回到顶部鉴定手段

  • (1)常规鉴定

    常规鉴定内容有形态特征和生理生化特征。形态特征包括显微形态和培养特征;理化特性包括营养类型、碳氮源利用能力、各种代谢反应、酶反应等。

  • (2)BIOLOG碳源自动分析鉴定

    BIOLOG鉴定系统以微生物对不同碳源的利用情况为基础,检测微生物的特征指纹图谱,建立与微生物种类相对应的数据库。通过软件将待测微生物与数据库参比,得出鉴定结果。

    该系统已获美国FDA认可,已逐步应用于食品和饮品企业、环保、海洋生物/水产品、制药、农业微生物、生物治理、化妆品、临床等领域的微生物鉴定试验中。

    BIOLOG是一种微生物菌种快速鉴定系统,涉及革兰氏阴性菌、革兰氏阳性菌、厌氧菌、酵母、丝状真菌在内近2000种微生物。

  • (3)分子生物学鉴定

    应用分子生物学方法从遗传进化角度阐明微生物种群之间的分类学关系,是目前微生物分类学研究普遍采用的鉴定方法。CICC拥有微生物菌种分类鉴定的分子生物学实验室,配有PCR仪、高速冷冻离心机、电泳仪、HPLC、凝胶成像系统、紫外控温分析系统等先进仪器设备,以及DNAMAN、BIOEDIT、CLUSTALX、TREEVIEW等序列分析软件。目前CICC可采用核酸序列分析法分析细菌16S rDNA/16S-23S rDNA区间序列、酵母18S rDNA/26S rDNA(D1/D2)序列及丝状真菌的18S rDNA/ ITS1-5.8S-ITS2序列,提供科学的鉴定结果。

  • (4)API细菌数值鉴定系统

    API鉴定系统涵盖15个鉴定系列,约有1000种生化反应,目前已可鉴定超过600种的细菌。鉴定过程中,可根据细菌所属类群选择适当的生理生化鉴定系列,通过软件将待测细菌与数据库参比,得出鉴定结果。

    CICC目前可应用API 50CH系列、API 20 E系列、API Staph系列对乳酸杆菌(Lactobacillus sp.)和相关细菌、芽孢杆菌(Bacillus sp.)、葡萄球菌属(Staphylococcus sp.)、微球菌属(Micrococcus sp.)和库克菌属(Locuria sp.)进行鉴定。

  • (5)功能性分析及功能基因

    CICC不断致力于工业微生物资源的功能及其功能基因研究,目前通过木聚糖酶、纤维素酶、葡萄糖异构酶、β-甘露聚糖酶等功能基因的克隆进行菌种产酶的功能性分析。应用gyrA、atpD及pheS等看家基因于微生物菌种鉴定,在某些种、亚种、株间有较好的分辨效果。

  • (6)RAPD、SSCP技术

    随着微生物菌种应用的进一步发展,在食品安全管理、生物产品出口认证、知识产权保护等行业需求日益增加,微生物菌种株水平的鉴别技术成为一个迫切需要解决的问题。

    CICC采用随机扩增多态性DNA(Randomly amplified polymorphism DNA,RAPD)技术和单链构象多态性(Single Strand Conformation Polymorphism,SSCP)技术对微生物菌株进行鉴别。如采用RAPD技术能够对同一菌种原始菌株与诱变菌株进行鉴别,对诱变菌株知识产权保护具有重要意义;采用SSCP技术进行工业酒精酵母菌株的鉴别,此技术结合菌株发酵特性,在酒类生产的质量控制方面起到积极作用。

  • (7)TLC薄层层析

    CICC将TLC薄层层析技术应用于微生物菌种鉴定,进行细菌、放线菌细胞壁化学组分分析(氨基酸、糖),作为划分属特征的重要鉴定技术手段,起到了良好的辅助作用。

  • (8)全细胞脂肪酸分析鉴定系统

    采用Sherlock全自动细菌鉴定系统,通过对不同菌株的脂肪酸图谱进行分析,并与标准数据库进行比对,来鉴定细菌及酵母。该技术是细菌或酵母种水平鉴定的有效手段之一。

  • (9)(G+C)mol%及DNA/DNA杂交

    CICC通过采用DU800核酸蛋白分析仪测定Tm值,从而得到微生物菌株的(G+C)mol%,并与模式菌株进行DNA/DNA同源性分析,该鉴定技术手段是多相鉴定的重要组成部分。

  • (10)实时荧光定量PCR

    实时荧光定量PCR仪是特异性靶基因检测与定量的一体化系统,其将PCR热循环、荧光检测和各种应用分析软件结合在一起,可以动态观察PCR每一循环各反应管中PCR扩增产物逐渐增加的情况。根据荧光强度确定PCR产物的定量法主要有荧光染料(SYBR Green I)法和荧光探针(Taqman probes)法。与常规PCR相比,它具有特异性更强、有效解决PCR污染问题、自动化程度更高等特点。实时荧光定量PCR技术目前已得到广泛应用,包括基于相对定量分析的基因表达分析,以标准曲线为基础的菌株绝对定量分析,定性的PCR扩增后核酸序列的SNP基因型分析,以及以阳性内对照为基础的阳性/阴性结果判定等。

  • (11)微生物菌群分析(DGGE)

    DGGE(denaturing gradient gel electrophoresis),即变性梯度凝胶电泳,是根据DNA在不同浓度的变性剂中解链行为的不同而导致电泳迁移率发生变化,从而将片段大小相同而碱基组成不同的DNA片段分开。DGGE已广泛用于分析自然环境中细菌、蓝细菌、古菌、微型真核生物、真核生物和病毒群落的生物多样性。这一技术能够提供群落中优势种类信息并同时分析多个样品,具有可重复和操作简单等特点,适合于调查种群的时空变化,并且可通过对条带的序列分析或与特异性探针杂交分析鉴定群落组成。

  • (12)微生物菌群分析(克隆文库构建)

    当微生物菌群中含有不可培养或难培养菌种,且其丰度较低时,要全面解析菌群结构及多样性,只采用传统的平板分离或PCR-DGGE分析难以达到理想结果,这时可以结合构建16S rDNA 克隆文库的方法。细菌16S rDNA扩增产物经0.8%的琼脂糖凝胶电泳,EB染色,在UV下显现,从胶上切取DNA条带,经纯化后,链接到pGEM®-T Easy 载体,并转化入大肠杆菌(Escherichia coli)。待长出白色菌落后,挑选白色菌落进行菌落PCR-DGGE(16S rDNA V3)辅助筛选,得到特定菌群中的所有克隆菌,再经质粒提取,基因测序后,便可得到特定微生物菌群信息。

  • (13)细菌呼吸醌组分测定

    细菌细胞膜上的呼吸醌有甲基萘醌(menaquinone,MK)和泛醌(ubiquinone,辅酶Q)。对革兰氏阳性的放线菌而言,通常只含有甲基萘醌。常用来分析呼吸醌的方法有薄板层析法和高压液相色谱法等。醌分子中的多烯侧链长度及氢饱和度对于细菌具有重要的分类学意义。

  • (14)细菌磷酸类脂分析

     磷酸类脂(phospholipioides)属极性脂(polar lipid),与蛋白质、糖等构成细胞膜,对于物质运输、代谢及维持正常的渗透压都有重要作用。不同属菌的磷酸类脂组分是不同的,它是鉴别属的重要特征之一,是化学分类项目中不可缺少的分类指征。磷脂种类很多,对于放线菌而言,具有分类学意义的磷酸类脂有5种:磷脂酰乙醇胺(phosphatidyl ethanolamine,PE)、磷脂酰胆碱(phosphatidyl choline,PC)、磷脂酰甲基乙醇胺(phosphatidylmethyl ethanolamine,PME)、磷脂酰甘油(phosphatidy glycerol,PG)及GluNU(含葡萄糖胺未知结构的磷脂,phospholipid of unknown structure containing glucosamine)。

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