酸奶生产菌种

德氏乳杆菌保加利亚亚种（Lactobacillus delbrueckii subsp. Bulgaricus）

嗜热链球菌（Streptococcus thermophilus）

纳豆生产菌种

纳豆芽孢杆菌(Bacillus natto)，分类学名称为枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)

红曲生产菌种

红曲红曲(Monascus anka)，分类学名称为紫色红曲（Monascus purpureus）

食醋生产菌种

巴氏醋杆菌巴氏亚种 Acetobacter pasteurianus subsp. pasteurianus

酱油生产菌种

米曲霉Aspergillus oryzae

味精生产菌种

谷氨酸棒杆菌Corynebacterium glutamicum

腐乳生产菌种

雅致放射毛霉Actinomucor elegans

大酱生产菌种

米曲霉Aspergillus oryzae

耐高温淀粉酶生产菌种

地衣芽孢杆菌 Bacillus licheniformis

糖化酶生产菌种

黑曲霉 Aspergillus niger

蛋白酶生产菌种

枯草芽孢杆菌Bacillus subtilis 

白酒增香生产菌种

科氏梭菌Clostridium kluyveri

异常汉逊酵母异常变种 Hansenula anomala var. anomala

丙酮丁醇生产菌种

丙酮丁醇梭菌 Clostridium acetobutylicum