※ 1953年，工业微生物菌种保藏组在上海工业试验所发酵室成立，开展工业微生物菌种的保藏管理工作

※ 1958年，菌种组随发酵室迁入北京，组建轻工业部发酵工业科学研究所，逐步建立了较为完备的菌种保藏管理体系，在国内确立了工业微生物菌种保藏管理的中心地位

※ 1979年，中国微生物菌种保藏管理委员会成立，CICC由轻工业部归口组建，挂靠中国食品发酵工业研究所，并在北京、上海、天津、黑龙江、内蒙、四川、湖南和广东设立八个菌种分站，建立了全国性的工业微生物菌种资源收集保藏管理网络体系

※ 1983年，与国内其它菌种保藏中心联合出版《中国菌种目录》（第一版）

※ 1986年，出版《中国工业菌种目录》

※ 1988年，加入世界菌种保藏联合会（WDCM582）

※ 1992年，出版《中国菌种目录》英文版（第二版）

※ 2001年，建立中国工业微生物菌种资源网

※ 2002年，再版《中国工业微生物菌种目录》，并建立国际工业微生物菌种资源交流中心

※ 2003年，CICC进入国家微生物菌种资源平台建设项目（隶属国家自然科技资源平台、国家科技基础条件平台）

※ 2004年，CICC承担国家工业微生物菌种资源平台建设项目，负责全国工业微生物资源的整理整合和共享平台建设